Mikrohabitatları ayırt etmek, aynı alanı tek bir ortalama sıcaklık veya nem değeriyle temsil etmeyi zorlaştırır. Güneş gören taş yüzeyiyle nemli yaprak döküntüsü, aynı yerde farklı canlılar için farklı barınma ve beslenme koşulları yaratabilir. Çevresel bir etkinin canlılara nasıl yansıdığını anlamak için örnekleme noktasının ölçeği, ölçüm zamanı ve bu küçük alanların dağılımı da hesaba katılmalıdır.