Toprak yalnız o mevsim görünen bitkilerin zemini değildir. Toprak tohum bankası, yüzeyde veya toprağın içinde canlılığını koruyan ve uygun koşullarda çimlenebilen tohumların oluşturduğu birikimdir. Bir bölümü kısa sürede çimlenirken bazı tohumlar ışık, sıcaklık, nem ya da kabuğun aşınması gibi işaretleri bekleyebilir; kuraklık, otlatma, yangın veya toprak işlemesi de hangi türlerin yüzeye çıkacağını değiştirebilir.
Bu nedenle yağıştan sonra beliren fideler bankanın tamamını göstermez, yalnız o dönemde koşullara yanıt veren kısmını görünür kılar. Tersine, yüzeyde bir türün görülmemesi tohumunun toprakta bulunmadığını kanıtlamaz. Mevsimler boyunca yapılan çimlendirme denemeleri, farklı derinliklerden örnekler ve mevcut bitki örtüsüyle karşılaştırma daha sağlam bir iz verir; toprak takvimi çoğu kez yeşeren ilk yapraktan daha uzundur.