Biyolojik toprak kabuğu, toprağın yüzeyinde alg, liken, yosun ve başka mikroorganizmaların oluşturduğu canlı örtüdür. Yüzeyin suya geçirgenliğini, akışını ve erozyona açıklığını değiştirebilir; kurak alanlarda toprağın döngüsünü okurken çıplak görünen zeminin canlılığını da hesaba katmayı gerektirir.