Toprak yüzeyindeki yaprakların gömülmesi, küçük oyukların açılması veya farklı renkli katmanların birbirine karışması yalnız yağmurun işi olmayabilir. Biyotürbasyon, canlıların kazma, beslenme, hareket etme ve yuva kurma etkinlikleriyle toprak ya da tortuyu fiziksel olarak yeniden düzenlemesidir. Solucanlar, karıncalar, köstebekler ve tabanda yaşayan omurgasızlar farklı derinliklerde iz bırakabilir; bu etkinlik suyun sızma yollarını, havalanmayı ve organik maddenin dağılımını değiştirebilir.
Etkinin yönü canlıya, toprağın nemine ve dokusuna, mevsime, bitki örtüsüne ve bozulmanın şiddetine bağlıdır. Açılan kanallar bazı koşullarda suyun içeri girmesini kolaylaştırırken, gevşetilmiş yüzey başka koşullarda taşınmayı artırabilir. Tek bir delik tür teşhisi veya süreç hızı için yeterli değildir; girişlerin, dışkı yığınlarının ve katman değişiminin aynı alanda tekrarlı kaydı daha sağlam bir karşılaştırma verir. Biyotürbasyonun ekolojik işlevi, işareti bırakan canlı ve sonuçlanan toprak değişimi birlikte izlenebildiği ölçüde savunulabilir.