Mikrohabitat, daha geniş bir yaşam alanı içinde sıcaklık, nem, ışık, yüzey yapısı veya barınak bakımından çevresinden ayrılan küçük ölçekli yaşam koşulları bütünüdür. Aynı orman parçasında ağaç kovuğu, kabuk altı ve çürüyen kütük farklı mikrohabitatlar oluşturabilir; alan küçük diye ekolojik işlevi de küçük sayılmaz.