Uygulama maliyeti, bir ürün veya sistemi satın aldıktan sonra gerçekten kullanılır hâle getirmek için gereken kurulum, veri taşıma, uyarlama, eğitim ve geçiş sırasındaki verim kaybıdır. Etikette görünmez ama alternatifleri karşılaştırırken satın alma bedeline eklenir; ucuz lisans, pahalı geçişle pahalılaşabilir.