Aynı ağacın gölgeli kök çevresiyle birkaç adım ötedeki çıplak toprak, canlılar için aynı yer değildir. Mikrohabitat, daha geniş bir habitat içinde nem, ışık, sıcaklık, örtü ya da yüzey yapısı bakımından çevresinden ayrılan küçük yaşam alanıdır; ekolojik anlamı ancak bu koşulların hangi mevsimde ne kadar sürdüğü ve hangi canlılarca kullanıldığı birlikte izlendiğinde anlaşılır.