Toprağın çıplak görünmesi, bitki örtüsünün bütün geçmişinin silindiği anlamına gelmez. Toprak tohum bankası, yüzeyde ya da toprağın içinde canlılığını koruyan ve koşullar uygunlaştığında çimlenebilen tohumların oluşturduğu birikimdir.
Bu birikimin bileşimi yalnız çevrede hangi bitkilerin görüldüğüne bağlı değildir. Tohumların alana gelişi, gömülme derinliği, dormansi, çürüme, hayvanlar tarafından yenme veya taşınma ile önceki yangın, sürme ve otlatma gibi etkiler hangi türlerin ne kadar süre bekleyebildiğini değiştirir. Yağış, sıcaklık, ışık ve toprağın bozulması bazı tohumlar için kapıyı açarken başkaları için yetmeyebilir. Bu yüzden tek mevsimde çıkan fideleri bütün bankanın dökümü saymak, takvimin bir yaprağını arşivin tamamı sanmaya benzer. Karşılaştırılabilir toprak örnekleri veya yinelenen çimlenme gözlemleri farklı mevsimler boyunca tutulduğunda, görünen bitki örtüsü ile topraktaki olası süreklilik arasındaki bağ daha güvenle yorumlanabilir.